熒光顯微鏡原理是通過激發(fā)式光源，將光學(xué)顯微鏡與化合物的熒光染料發(fā)射相結(jié)合的一種顯微觀察模式。在生物學(xué)中使用的多數(shù)熒光顯微鏡為落射熒光顯微鏡。

熒光顯微鏡的組件

光源（氙氣燈或水銀弧光燈）：水銀弧光燈發(fā)出的光比大多數(shù)白熾燈亮 10-100 倍，并提供從紫外線到紅外線的各種波長的光。

激發(fā)濾光片：激發(fā)濾光片的目的是濾除光源的所有波長，被檢熒光團的激發(fā)范圍除外。圖像的亮度和亮度由濾光片的*小透射百分比決定。理想的透射率> 85%。

分色鏡（分束器）：分色鏡或分束器以 45° 角放置在激發(fā)濾光片和發(fā)射濾光片之間。二向色濾光片的功能是將激發(fā)信號反射到熒光團，并將發(fā)射信號傳輸?shù)綑z測器。

發(fā)射濾光片：發(fā)射濾光片位于熒光顯微鏡的成像路徑內(nèi)。它的工作是過濾掉整個激發(fā)范圍并傳輸被檢查熒光團的發(fā)射范圍。

物鏡：物鏡的目的是將光傳輸?shù)綐悠飞弦研纬蓤D像。光在到達(dá)物鏡之前穿過分色鏡。

攝像系統(tǒng)：攝像系統(tǒng)有助于以高分辨率記錄標(biāo)本的圖像。系統(tǒng)中經(jīng)常使用CCD（電荷耦合器件）相機。這些電子倍增相機擅長在不損失靈敏度的情況下對單光子事件進行成像。它們不需要圖像增強器，并且可以高速捕獲圖像。